Антитело TRA-1-81 реагирует с углеводным эпитопом на TRA-1-81, высокомолекулярным гликопротеином (> 200 кДа), который экспрессируется на поверхности человеческих клеток эмбрионального рака (ЕС), клеток зародыша (EG), эмбриональных стволовых клеток (ES) и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (iPS), равно как и на клеточных линиях эмбриональных стволовых клеток макак резус и крыс. Иммунореактивность отсутствует у мышиных клеток EC, EG, ES и iPS. Эпитоп антитела TRA-1-81 связывается с кератин-сульфатным трансмембранным белком — подокаликсином, и резистентен к воздействию нейраминидаз.