Коллагеназа представляет собой протеазу, состоящую из одиночной полипептидной цепи, включающей 1000 аминокислотных остатков в длину. Коллагеназа способна растворять нативные коллагеновые фибриллы, обычно находящиеся в соединительных тканях, в связи с чем часто используется для диссоциации тканей. Препараты коллагеназы обладают активность нескольких протеаз, включая коллагеназу, казеиназу, клострипаин и трипсин (Kessler & Yaron). Коллагеназа III типа обладает низкими уровнями протеолитической активности, основные среди которых — активность казеиназы, клострипаина и трипсина. Коллагеназа III типа используется для растворения тканей молочной железы (Rønnov-Jessen et al.), стволовых опухолевых клеток рака толстой кишки (Prince et al.) и опухолевых клеток эпителия грудной клетки (Chan et al.).